五股垃圾山地區不只有違建廠房問題，當地還有許多廠家人員所放養犬貓，新北市政府動保處自106年起即關注到這個問題，為避免犬貓不斷繁殖，持續為當地犬貓絕育，108年9月1日起新北市政府為改善環境，生效「擴大五股都市計畫案發布前試辦計畫」，後續無法合法申請廠家將面臨拆遷命運，動保處為了避免廠家拆遷後犬貓遺留在當地問題，自109年4月13日起成立專案小組，以避免後續犬貓流離失所。
專案小組成員包括當地協會及愛心餵養人士，已於4月29日至現場實地勘查廠家餵養犬貓狀況，進行盤點，估計約有415隻狗及200隻貓，另五股幼幼保育場內還有292隻狗及8隻貓，保育場內犬貓由該協會自行安置，五股公立動物之家獸醫林洋演自106年至今，已協助該協會絕育16隻狗及78隻貓，另五股動物之家106年至今亦於當地救援及收容了53隻狗及73隻貓，並完成其中26隻狗及54隻貓的絕育，動保處也補助懷生相信動物協會進行當地母狗絕育工作。
日前五股垃圾山區域內大排水溝出現7隻狗，疑似是整地造成狗受到驚嚇跌入，目前5隻狗已救出安置五股動物之家，該5隻狗並無寵物登記，後續將在動物之家完成絕育後開放認養，動保處表示，廠家拆遷時應將所飼養犬貓帶走，後續如在當地查獲棄養犬貓者，依動物保護法可處最高15萬元罰鍰，並列為黑名單，不得再飼養犬貓。
農業局長李玟表示，流浪動物問題是人所造成，惟有透過源頭管理，才有辦法解決流浪動物問題，五股垃圾山犬貓數量非一時半刻可以處理完畢，靠政府與民間力量一起合作，才能加快處理的腳步，動保處將分階投進行當地犬貓救援或收容作業，避免後續犬貓流離失所，讓新北市成為友善城市。
